感谢大家的支持，欢迎给我留言！

另外，也欢迎合作，包括实验（质粒构建，WB，流式细胞术以及常规毒理学实验等），网站制作，R语言分析绘图，视频制作等，都可。感兴趣可移步至我的简历，底部悬浮按钮可添加微信或邮件联系。

405 Replies to “给我留言”

  2. 老师您好呀，按照您5ｍＣ甲基化引物的设计方法，我已经设计出了引物，非常感谢！我还有一个问题，用甲基化的引物可以blast到亚硫酸盐转换后的DNA序列，但是未甲基化的引物不能blast原序列（您的TXNIP和我自己的目的基因都是），这种情况是OK的吗？希望得到您的解答。

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  3. 进哥，TCGA data分析小程序里进行DE分析时.报错没有发现DESeqDataSetFromMatrix函数，怎么解决啊？

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  4. 王老师，您好，我最近在做mRNA稳定性这一块，我按照您的提取方法到测RNA浓度的时候，确实是呈梯度降低的情况，但是在等体积逆转录后，这个趋势降低的情况就被消除了，最后测出来的qPCR也是呈现上上下下不断波动的情况，想知道这种情况是什么原因，又该怎么解决呢？

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  6. 王老师，请问如果endnote X9在使用PubMed搜索文献过程中无法连接服务器，一直报错怎么办呢？

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  7. 老师，请问临床医学专业的学生初学习基因编辑，有系统学习的视频或者书籍推荐吗？目前生科基础很薄弱，学起来很费劲，很困惑。感谢！

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    1. 其实工具性的东西，没有必要系统性学习，看一些相关的分析生物学知识点就可以，本身不是很难，我B站有一个视频对原理方法做了一点讲述，你可以看看，不懂的可以加微信交流

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  8. 王老师您好！从读研开始就一直在您的网站上查找各种资料，我得到了很多帮助。最近开始进行生物信息学的一些分析，不知道您是否进行过GWAS数据的分析和处理，如果您做过的话期待您能出一期这方面的内容，非常感谢！祝您和家人身体健康，工作学业顺利！

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    1. 您好，目前大部分分享的都是我平时会用的。GWAS目前还没有涉及，等后面接触了再和大家分享，谢谢你的建议

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  10. 你好。我想问一下双因素方差分析。问卷设计的时候是四级量表（0=strongly disagree; 1=Disagree; 2=Agree; 3=Strongly disagree”)，想研究参与者选择这个题目与两个因素的关系。因为因变量不是大的数字（不是成绩），这个如何进行双因素方差分析呀？谢谢！

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  12. 现在的NCBI账号出现注册不了的情况，也只有Login.gov这一栏可以注册，在最后电话号码验证时界面卡着不动

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  13. 您好，零基础小白接触分子生物学实验，可以请教出一期详细的PCR原理和教程吗

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  14. 王老师您好！请问您是否有兴趣出一期关于xCell分析结果绘图的内容，我使用修改后的cibersort绘图代码绘制xCell的分析结果总是得到乱码图片 T T 谢谢！

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  15. 老师，我是第一次做肿瘤实验，没有经验前几天造过一次模做预实验，但是每只鼠的肿瘤生长情况不一样，有的大有的小，大的可能长成很快，但是等小的肿瘤一块长成以后再分组的话大的肿瘤就太大了，无法兼顾和合理随机分组，请问我该怎样做来解决这个问题呢？
    第二就是我也是造的肺癌模型，但是是用LLC细胞造模的我做的材料对吸光度影响很大，每次在做细胞实验的时候都会在给CCK-8以前洗板几次才能够洗干净，但是LLC细胞很容易被洗掉，以至于实验结果出现在同样条件下正常细胞存活率高，LLC细胞存活率低的情况，我无法确认这中差别是材料本身就对正常细胞毒性小，对LLC细胞毒性大还是LLC细胞被我洗掉 了造成的影响，我该如何判断呢？

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    1. 你好，不好意思 给刚看见消息
      可以进群讨论，https://www.jingege.wang/jingle_science/
      也可以加我微信直接电话沟通，我的简历有手机号，问题太长了。。。

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  17. An error has occurred. Check your logs or contact the app author for clarification
    老师用PUbMEBS检索基因出不来 An error has occurred. Check your logs or contact the app author for clarification 想请教一下是哪里出了问题呢

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  18. 老师您好，我有个问题想请教一下您，就是现在新版的TCGA下载的表达数据里面有tpm_unstranded数据，请问一下这个数据还需要做什么处理吗？可以直接用来做分析吗？我用这个数据进行预后分析发现结果与在线网站上分析的结果不一致，试了log处理再分析也不对，十分感谢！我也搜索了很多数据处理信息，并没有关于这个数据的处理方法，或许您是否可以做个分享？

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  19. 王博您好！在查找数据分析方法过程中无意间进了您的网站，简直是发现了宝藏！感谢您成立这个网站并在此分享科研方法，非常受用！！
    但是最近有个问题困扰着我，在原图没有标尺的情况下，如何使用imageJ准确测量长度呢？或者说，在原图没有标尺的情况下，已知像素和放大倍数，如何使用imageJ添加标尺呢？或者是否有其他软件可以替代的？敬请王博指导，非常感谢！

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  20. 进哥，您好！我想要向您咨询一些关于克隆形成实验的内容。
    1.我看了有的文献有写细胞给药处理24h后更换新鲜完全培养基，请问这样的话还能说明是药物作用问题还是培养基的问题吗？我如果要看48h药效是否可以48h后换新鲜完全培养基呢？
    2.关于细胞给药时间。是不是应该得等细胞接种24h后再给药呢？还是直接给药呢？

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  21. 进哥，我做的是miRNA多重qPCR，然后我想问一下
    1、探针的Tm值计算和引物是一样的吗？
    2、我之前用的是赛默飞自带的primer expression3 里面有一个工具，可以直接给出探针的Tm值，不知道还有没有其他的推荐呢？
    3、对上面的问题的补充，特殊的像MGB探针除了用上面的软件以外，还有哪些软件可以计算MGB探针的Tm值呢？

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  22. 王进师兄，非常感谢你在百忙之余建立的个人网站，帮我解决了很多问题，谢谢您！

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  23. 老师能不能在”GTEx联合TCGA数据库泛癌基因表达差异分析”，再多做一个生存分析的比较呀？期待更新

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  24. 王博好，请问您测序以后得到目的基因与TF的结合片段后，chip qpcr引物的设计怎么搞？感谢

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    1. 您好，如果得到是只是一个结合位点的话，依据这个位点找到侧翼序列，设计qpcr引物，包含这个结合位点即可，产物长度80-120吧，不要太长。
      如果得到的就是一段，那就根据这一段设计引物，当然也可以往侧翼序列拉长一点

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      1. 哇哈哈，王博居然这么快回复我了，真没想到！我的测序结果是靶基因的起始位点和结束位点，例如Xkr4基因的chr1：3121337—3121583，请问我怎么找到这段序列？这个是小鼠mm9基因组序列比对的结果，我是否需要下载小鼠mm9基因组序列，依据chr1：3121337—3121583找到这段序列？或者有其他什么方法？谢谢啦！

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        1. 如何根据染色体坐标快速得到基因组的 DNA 序列 – 王进的个人网站
          https://www.jingege.wang/2021/11/22/%e5%a6%82%e4%bd%95%e6%a0%b9%e6%8d%ae%e6%9f%93%e8%89%b2%e4%bd%93%e5%9d%90%e6%a0%87%e5%bf%ab%e9%80%9f%e5%be%97%e5%88%b0%e5%9f%ba%e5%9b%a0%e7%bb%84%e7%9a%84-dna-%e5%ba%8f%e5%88%97/
          这里有方法，当然用R语言biomart包也可以很快实现，本来还考虑要不要做个小程序根据坐标获取序列，想着用的人不多，就没做

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  28. 老师，您好，请问是否由genorm这个软件学习的相关视频呢，想学习这个软件如何使用，一直没有找到资源

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  29. 老师您好，想问您一下msp引物的设计是以该基因前2000bp的启动子序列来设计的吗？我看有些文献并不是以启动子区域来设计的，最近正在学习引物设计有些困惑，望回复，谢谢！

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    1. 您好，这个取决于你的目标序列，一般而言做启动子区域的比较多，因为DNA甲基化主要被大家熟知的就是对启动子区域的调控。最近我在B站上发布了相关介绍和设计流程：https://www.bilibili.com/video/BV1Nh4y1577V/

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  31. 王老师，您好。一直跟着您的网站学习，您的网站伴随了我的整个研究生生涯，内心万分感激。最近我在一个磷酸化蛋白的免疫共沉淀，一直没有很好的方法保持蛋白的磷酸化，不知道您是否有好的建议可以让细胞内磷酸化的蛋白处于稳定状态，不发生去磷酸化。期待您的回复，万分感谢！

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    1. 您好，谢谢肯定！关于磷酸化蛋白我我没有怎么做过，还真不知道怎么解决，能想到的应该也是你已经做了的，加磷酸化蛋白酶抑制剂，其它我也不清楚诶

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  32. 王博你好，我在苏大附近的纳米园，偶然看到你的网站，希望以后可以多向你学习。你是一个愿意分享知识的人

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  33. up想问一下，视频里的代码可以从哪里看到啊，想看看源码学习一下

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    1. 您好，视频里面应该能看清楚代码的吧？有些代码我网站有完整的，有些复杂的可能需要购买，几块钱意思一下，我会添加淘宝链接到评论区

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    1. 嘿嘿，谢谢谬赞，B站代码视频应该能看清楚的吧？有些代码网站上有完整源码，有些稍复杂的需要付点前，我添加链接到评论区

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  35. 哈哈哈，觉得好好玩，感觉是个超优秀的王博～持续关注了

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  36. 你好帅哥，我也是才开始学这个的，实验室他们做癌症转移，但是甲基化，淋巴和远端转移师兄们都在做了，所以一直没有好的想法，因为我是纯学计算机上来的所以不会生物，希望进哥给点建议和想法，确实我对生物太不了解了。

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  37. 您好，我有和您学员一样的想法，现在已经分析出来了相关基因，但是强相关基因很多。为了进一步研究，我现在想分析与某一个药物预后相关的基因，然后取两个结果的并集继续试验。但是我找不到与药物预后相关的临床样本数据，请问您有什么建议吗。期待您的回复。

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    1. 您好 可以电话讨论 你可以加我微信先，我下午一个下午监考 明天或许可以讨论一下
      18021308280

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    1. 可以的，没问题 您把您单位、姓名发送到这个邮箱（合作导师：李建祥，苏州大学苏州医学院公共卫生学院）：aljxcr@suda.edu.cn 说明一下

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