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Cytoscape 是一个广泛应用于生物信息学领域的开源软件平台,专门用于可视化和分析复杂网络数据。它最初是为生物学研究设计的,但由于其强大的数据处理和图形可视化能力,现已被广泛应用于多个学科。Cytoscape 允许研究人员通过图形化界面来展示和探索分子网络,并将这些网络与实验数据(如基因表达、蛋白质相互作用等)进行整合分析。

进哥用的3.9.1版本。

Cytoscape 4.0 的重要变化

在 Cytoscape 4.0 版本中,出现了一个显著的变化——App Manager(应用管理器)不再包含在这个版本中

安装方法:

方法一:

返回安装旧版本的Cytoscape

方法二:

1. 用梯子翻墙(国内无法下载。当然,进哥这么贴心,肯定会给大家下载好)

2. 打开网站

Cytoscape App Store

3. 搜索下载

C:\Users\JinWa\Documents\WeChat Files\wangjin930302\FileStorage\Temp\1723176723325.png
不翻墙的话,下载按钮不显示,点击没反应。

没事,看我表演:

浏览器中按F12,下载链接就现身了,具体流程可以查看B站视频。如下,点击那个链接即可下载app

C:\Users\JinWa\Documents\WeChat Files\wangjin930302\FileStorage\Temp\1723176959745.png

一向贴心的进哥已经通过爬虫提取了所有下载链接,并下载了所有插件,关注公众号发送cytoscape app获取链接。

下载下来之后,安装就比较简单了,不多介绍了。大家有需要有问题请留言。

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