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Human Protein Atlas 数据库,简称HPA数据库,它致力于提供全部24,000种人类蛋白质的组织和细胞分布信息,并免费提供公众查询。 创立这个数据库的瑞典 Knut & Alice Wallenberg基金会使用特制的抗体,用免疫组化的技术,检查每一种蛋白质在48种人类正常组织,20种肿瘤组织,47个细胞系和12种血液细胞内的分布和表达,其结果用至少576张免疫组化染色图表示,并经专业人员阅读和标引。这些受检组织来自144个不同个体和216个肿瘤组织,保证染色结果具有充分的代表性。这是一个大规模蛋白质研究项目,主要目的是绘制人体组织和细胞中表达基因编码的蛋白位置。 举个栗子,查询明星基因pten的表达情况 1在搜索栏输入基因名称。点击search。
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2搜索结果如下:首先是对PTEN基因的描述:致癌基因、肿瘤相关基因,然后是pten在组织,细胞,肿瘤中表达。
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3点击组织栏,查看pten在人体各组织表达情况,又可分为RNA 表达以及蛋白表达。
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4点击人体组织表达图谱右侧组织名称,比如睾丸,可以查看组织免疫组化图。在网页的左侧显示标本信息以及蛋白亚定位。可以参考作为免疫组化的阳性对照。
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5点击细胞栏,可以查看基因在细胞系RNA表达水平,以及人类细胞系、小鼠细胞系中定位。在查看细胞定位的荧光图时,可以通过点击选择需要显示的内容:抗体,细胞核,微管等等。即可单独显示又可以叠加显示。
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6点击肿瘤栏,可以查看基因在不同肿瘤样品中的蛋白表达情况。点击组化图可以查看样品的定位,同样在网页左侧栏显示标本的详细信息。
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