shRNA的设计
https://portals.broadinstitute.org/gpp/public/gene/search
在这里输入基因的转录本号
点进来可以看到很多，下载csv文件，选取前面的设计好的引物
需要参考下面这篇文章里的方法将质粒载体换成自己所用的，也就是将前后酶切位点和中间的loop序列替换掉：
shRNA序列设计与载体构建
shRNA序列设计与载体构建
shRNA的设计 ——GPP Web Portal
请问shRNA的序列设计没有鸡这个物种吗
可能没有可以直接选择的工具，不过很多设计工具都可以基于序列，只要有序列就可以
您好，想再问您一下，我要设计一个阴性对照序列该怎么设计呢？我老师让我找一条阴性对照序列放到同样的载体上。
easy 找一个你所研究物种上没有的基因进行设计 for example 绿色荧光蛋白GFP基因 or 萤火虫荧光素酶基因luciferase
题主太优秀了！超级感恩！
您好，请问CSV文件中的match region 为3’UTR和CDS的，有啥区别呢？我应该怎么选呢？
您好，其实就是你设计的shRNA target的位置，CDS和3’UTR区域都能够导致其降解，从而影响其翻译，都可以选择，选择主要依据工具给出的评分Score 一般越靠前越可靠