划痕实验
使用imageJ插件:Wound Healing Tool
下载地址
http://dev.mri.cnrs.fr/attachments/download/1992/MRI_Wound_Healing_Tool.ijm
安装方法
上述文件放到imageJ文件夹中macros/toolsets下,重启imagej。
使用方法
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-0530fcb0cbd86285a17cfb759d0576d1.png)
点最右边的双箭头
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-ced8e40be00819a1b963672dc52938d7.png)
得到这样
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-b3cfd146a972b998c057acfb4639e4a1.png)
打开一个图片,左键点击m可以直接测量,右键点击m可以打开参数设置
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-81b49af2adab412e4ad77daf2b9b9d39.png)
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-d1b11d9a65446cb330a390a07706d1e0.png)
结果如下
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-992ed7afc7db20d54733dabd9e6bc99c-1024x603.png)
点击对应区域的编号,记录面积就可以了(本图是2号)。
migration
参考资料:http://www.sohu.com/a/240069404_650214
定量过程
打开一张图片
如图所示,image-type-8-bit
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-3ff10d010011fc45e7cdb2809a1ce1cb.png)
image-adjust-threshold调整阈值,细胞黑色为选择上,网孔可以有一点,后面可以筛掉,点击Apply。
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-e55464e73f0f2717c71d00765a4a35dc.png)
分割连在一起的细胞
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-34ab8873950b49f1c90fd3c7380fc73e.png)
计数
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-23cad373cac8b50a65c5c64013a5028b.png)
这里的参数调一下
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-9b8f69de36a5c808ea03c371a2bb687b.png)
结果如下:
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-ef60c4bf60b5f895087c0fdaedd9eb12-1024x904.png)
血管生成
使用工具
Angiogenesis Analyzer
http://image.bio.methods.free.fr/ImageJ/?Angiogenesis-Analyzer-for-ImageJ#outil_sommaire_0
下载地址
http://rsb.info.nih.gov/ij/macros/toolsets/Angiogenesis%20Analyzer.txt
安装方法
将插件下载到imagej的文件夹下/macros/toolset中,重启imagej。
定量过程
打开一张图片,打开Angiogenesis Analyzer
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-0fca1c4aaf319a7afed875bd3d1675ee.png)
直接定量
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-5d4ba1fe740139240560d10d8ecde951.png)
更改参数
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-8d556125e6dd7f2d03e4de5517ff8f8e.png)
CD31血管定量
定量过程
打开一张图片
image->Color->Split Channels
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-19e69cc61bff76198b238a7b9cd1b92a.png)
得到如下三张图(红绿蓝三个通道)
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-a068cf1d5ef265432d3c34d040f5f9df.png)
此图CD31染的红色,保留红色通道即可。
然后image->Adjust->Threshold,勾上Dark background,调整到合适的阈值,点Apply
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-6414ed99daf6c84accd7fdb688a7ddea.png)
Analyze->Set Measurements,勾上以下选项
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-b20f93dd70ca486373fb342f3a7acb91.png)
Analyze->Measure即可。
计算完后的结果:
![](https://www.jingege.wang/wp-content/uploads/2022/01/frc-3ea0764337ac33f6c74bc77f669fedba.png)
收藏了,博主别删!
谢谢,必定不会删
我是新来滴,这可真是宝藏博客啊!
谢谢