说起RNA甲基化,已知RNA存在超过100种修饰。在真核生物中,5’端的Cap以及3’的ployA修饰在转录调控中起到了十分重要的作用,而mRNA的内部修饰则用于维持mRNA的稳定性。mRNA最常见的内部修饰包括N6-腺苷酸甲基化(m6A)、N1-腺苷酸甲基化(m1A)、胞嘧啶羟基化(m5C)等。
如图所示,m6A就是在腺苷6位的N原子上插入一个甲基取代基。
m6A 影响mRNA前体的剪接 | m6A调控RNA的核输出 |
m6A调控mRNA翻译 | m6A影响mRNA的稳定性 |
m6A修饰促进环状RNA翻译 | m6A修饰改变可改变肿瘤发展 |
m6A调控造血干细胞定向分化 | m6A调控精子发生 |
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m6A这种甲基化修饰被证明是可逆化的,包括甲基化转移酶(Writers)、去甲基化酶(Erasers)和甲基化阅读蛋白(Readers)等共同参与。其中甲基化转移酶包括METTL3/14、WTAP和KIAA1429等,主要作用就是催化mRNA上腺苷酸发生m6A修饰。而去甲基化酶包括FTO和ALKHB5等,作用是对已发生m6A修饰的碱基进行去甲基化修饰。阅读蛋白主要功能是识别发生m6A修饰的碱基,从而激活下游的调控通路如RNA降解、miRNA加工等。
01
m6A甲基化转移酶
02
m6A去甲基化酶
在真核生物中,已发现的m6A去甲基化酶主要包括FTO和ALKBH5等。FTO蛋白全称Fat mass and obesity-associated protein,属于Alkb蛋白家族中的一员并且与肥胖相关,FTO被敲除或过表达都会显著改变小鼠的体重。ALKBH5是另一种重要的去甲基化酶,能够对细胞核中的mRNA进行去甲基化修饰,在N端有丙氨酸富集区和独有的卷曲螺旋结构(coiled-coil structure)。在细胞系中敲低ALKBH5后,mRNA上m6A修饰水平显著上升。
03
m6A甲基化阅读蛋白
您猜,植物中RNA是否也存着m6A修饰呢?
与哺乳动物一样,植物RNA也存在m6A修饰。大约在40年前,已经有国外的课题组首次在小麦、燕麦、胚芽鞘和玉米的RNA中发现m6A修饰。植物也有属于自己的甲基化转移酶(writers)、去甲基化酶(erasers)和甲基化阅读蛋白(readers)。研究表明,m6A修饰被认为在植物胚胎发育中起着关键作用,同时,也参与调节对各种非生物(abiotic)和生物胁迫(biotic stress)的反应。
什么公司做这种RNA甲基化比较好呢
这个我也不清楚,我们只合作过上海一家公司,感觉不太好,你可以联系几家比较一下
好的呢 谢谢~~