Posted on

      最新版 DNAMAN 10已经发布,但许可仍不完整,现特献上9.0版,以供大家学习研究之用。后续可用之时,将随时更新链接。

软件简介

Software description

      DNAman,是美国LynnonBiosoft公司开发的高度集成化的分子生物学应用软件,该软件包提供了 具有多功能功能的 集成系统,可进行高效的序列分析。您不再需要一个程序来进行限制性酶切分析,而不再需要其他程序来进行多序列比对、设计PCR引物、蛋白质序列分析或提取质粒……DNAMAN会为您执行所有这些任务。

 

 

      DNAMAN的 速度,多功能性,准确性 和 高质量的呈现,使其成为每个分子生物学家都可以依赖的基本工具之一。DNAMAN是许多同行评审的科学期刊中被高度引用的序列分析软件。 它也是一个序列分析软件包,为每所大学、研究机构、实验室和研究科学家提供软件包  。

功能简介

Software features    

      1、DNA和蛋白质序列编辑

      2、DNA序列转化

      3、多序列比对,对齐编辑和分析

      4、系统树分析

      5、DNA或蛋白质序列的点阵比较

      6、DNA序列组装和编辑

      7、BLAST通过网络界面在Intranet / Internet Server上进行搜索

      8、序列和数据库中的增强型图案搜索

      9、SiRNA选择器

      10、限制分析

      11、绘制序列图与出版品质

      12、限制模式预测

      13、电子克隆

      14、从限制片段重建限制图

      15、静音突变分析创建/破坏限制性位点

      16、导向不匹配以创建/破坏限制站点

      17、翻译和密码子使用分析

      18、蛋白质疏水性/亲水性分析

      19、蛋白质表征:等电点的序列组成和预测

      20、蛋白质二级结构预测

      21、反向翻译

      22、PCR和测序引物的设计

      23、表征DNA或引物序列的热力学性质

      24、分歧分析

      25、管理寡核苷酸,DNA和蛋白质数据库

      26、生成随机序列

DNAMAN

软件来源于网络,仅供个人研究使用,请勿做任何商用!
链接:https://pan.baidu.com/s/1FkugjEah5jvezKzB3njeTw
提取码:85f3
复制这段内容后打开百度网盘手机App,操作更方便哦

   官网链接   

https://www.lynnon.com

安装步骤

      1、双击.exe文件进入DNAMAN安装导向界面,点击【Next】继续安装。

截图

2、进入DNAMAN安装协议界面,点击【I accept the agreement】,然后点击【next】。

截图

3、选择DNAMAN安装位置,点击【next】,软件会默认安装,或者您可以点击【Browse】,弹出安装位置界面,您可以自己选择DNAMAN安装位置,选择完成后点击【NEXT】。

截图

4、准备安装DNAMAN,您可以检查一下软件安装位置是否正确,如果正确点击【Install】。

截图

5、DNAMAN软件正在安装中,您需要耐心等待软件安装。

截图

6、DNAMAN软件安装完成,点击【finish】退出软件安装。

截图

破解教程

1.安装完成后将破解补丁复制到安装目录下替换源文件即可,一般默认安装目录为:C:\Program Files (x86)\DNAMAN

截图

使用方法

1、打开软件点击软件顶部的点击File,在弹出的选择中选择new

截图

2、在新建好的对话框中输入DNA序列。

截图

3、输入完后,同时按住键盘上Ctrl和A,选中序列,并单击软件顶部“seq”图中以为大家标注出来。

截图

4、然后点击软件顶部的Sequence选项,在弹出的选项中点击Display,在二级菜单中点击Rev.Compl.Sequence

截图

5、然后就可以得到原序列的反向互补序列。

截图

DNAMAN设计引物

1、先要拿到自己要设计引物的目的基因。

2、打开DNAMAN软件,打开软件后点击软件菜单栏的Primer选项,在弹出的选择中选择Load Primer,在二甲菜单中选择From Input选项。

截图

3、导入文件后,点击菜单栏的Primer选项,在弹出的选项中选择Melting Temperature。

截图

4、打开Melting Temperature对话框,您可以修改Thermo这个选项,Thermo值一般在55℃到70℃之间比较好。

截图

5、从上图可以看到我们这20个碱基的Tm值只有49度,显然太低,需要增加碱基数量。我们取前24个碱基粘贴进去,点击下方Show Tm便可以看到这个引物的Tm值,发现是60.3度,很合适,就用这个了。这样正向引物就设计完了,把这24个碱基序列保存下来。

截图

常见问题

      如何用DNAMAN导出序列比对图?

1、打开DNAMAN软件,打开软件后,点击菜单栏的Sequence选项,在弹出的选项中选择Load Sequence,在弹出的二级菜单中点击Multiple,选择您要添加对比的文件。

截图

2、导入序列后,点击Sequence,在弹出的选项中选择Alignment,再选择Multiple Sequence Alignment,参数全部保持默认,点“下一步”就可以。

截图

3、然后就可以得到最终对比结果。

截图

软件功能

1、数据库管理

选择数据库|经理命令打开数据库管理器”对话框。

2、DNA和蛋白质数据库

该软件的数据库功能,允许用户组织DNA和蛋白质序列的不同科目。

3、编辑记录信息

有关特定记录的信息可以编辑。在序列列表框中,所有记录按字母顺序或记录顺序列出。每个记录名字的数量显示记录的记录号ID.用DNAMAN自动分配。因此,您可以为不同的记录使用相同的名称。

4、扫描序列的相似性

它扫描所有的序列记录在默认的数据库搜索当前序列的同源序列。如果默认数据库包含DNA序列,则默认序列必须是DNA序列。如果默认数据库包含蛋白质序列,则默认序列必须是蛋白质序列。DNAMAN将使用快速对准方法扫描数据库的序列相似性。您可以选择对结果的最终输出使用快速对齐或最佳对齐方式。

5、错配分析

错配分析的目的是找到所有可能的退火位点的DNA序列的引物在默认。此功能可用于PCR和DNA测序的引物选择。权重矩阵用来区分引物位置的重要性。由于引物在3’末端对目标DNA的匹配比PCR扩增的5末端更重要,所以更多的权重被赋予3’末端。为了提高PCR引物的特异性,应始终检查引物与靶DNA之间是否存在次级退火位点。

3 Replies to “DNAMAN 9.0 | 分子生物学应用软件神器”

发表评论

邮箱地址不会被公开。 必填项已用*标注