31 Replies to “miRBase数据库序列查找”

1. 你好，miRBase我一直打不开。方便帮忙找一下人类（Homo sapiens）所有的miRNAs数据吗？想下载下来进行分析比对。非常感谢您的分享！

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2. 您好这个数据库里有蓝莓（Vaccinium spp.）的miRNA数据吗？万分感谢

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3. 能找打大鼠的pri-miR-122的序列嘛？求大佬帮帮我，有偿，感谢！！！！

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4. 进哥，您分享的内容太实用啦~ps：可以求一下水稻的所有miRNA成熟序列吗？拜托了~

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5. 您好，请问怎么查找到直接的22bp的成熟序列呢？目前搜索到的序列应该是包含前体序列的

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   1. 都有的 往后拉
      在后面，底下那个小工具里面也可以查找，刚刚看好像打不开 我瞅瞅

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6. 您好，请问有大豆Gma-mir171i-3p、Gma-mir1513c miRNA的前体序列（茎环结构）和成熟序列吗，miRbase一直进不去，万分感谢。还想问一下，把这两个miRNA克隆出来是用前体序列还是成熟序列，设计引物的话就是顶头顶尾设计吗，有什么要求吗

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7. 您好，请问有大豆Gma-mir171i-3p的miRNA的成熟序列吗，miRbase一直进不去，谢谢你

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   1. 你好，最下面jingle’s tookit里面有，输入gma-mir171i-3p，gma小写 可以得到序列
      gma-miR171i-3p Sequence UUGAGCCGUGCCAAUAUCACG

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8. 您好进哥，老师给了茶树MiR163的相关序列，让我做克隆，要用5’RACE来获得全长基因，请问这个要怎么来设计引物？

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   1. 你好，其实也没啥特别注意的，只如果有下游的一段确定序列取个18-30bp作为引物就可以，引物就参考常规引物的要求即可
      我没有做过做过，是否是以miRNA序列本身作为引物？

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9. 您好，请问有毛竹(Phyllostachys edulis)的miR156的成熟序列吗，miRbase一直进不去，谢谢你

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   1. 请问毛竹miRNA三字母是什么？ 我没搜到 或者加我微信 发你全部的

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10. 您好，我想找跟mir-25相差1-3个bp的mir应该如何操作搜索呢，mirbase一直上不去

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    1. 如果需要全部miRNA数据 加我微信发你，如果是要可以模糊匹配比对那种 后面有时间我设计一下

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11. 你好，可以帮我找一下马铃薯（stu）的miR398的全部成熟序列吗？我自己在miBase搜索，一直不出结果。

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    1. 你加我微信发你吧

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12. 请问unchanged的sequence 指的是茎环结构嘛，可以把茎环结构也加上不，想查找几个mirna，比如mir21 29 182 let7的茎环结构，麻烦咯

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    1. Stem-loop就是指的pre-miRNA，也就是表格里面的第三列sequence

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       1. 好的好的谢谢进哥哥，可以区分出，哪里是环，哪里是茎不，来自一个刚开始研究结构，找结合位点寻求毕业的人hh

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          1. 利用二级结构绘图工具可以实现 当然miRBase上有现成的，如果你有确定的miRNA 留一个 我给你链接 后续需要查换一下连接上的名字即可

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             1. 最帅的进哥好，可以帮忙查一下miR-21的茎环结构嘛，谢谢进哥~

             2. 诶 什么物种？人的？hsa-mir-21 UGUCGGGUAGCUUAUCAGACUGAUGUUGACUGUUGAAUCUCAUGGCAACACCAGUCGAUGGGCUGUCUGACA

13. 你好，方便找一下家猪（pig）的miRNA吗？谢谢

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    1. 可以的 你发我名字 我发你
       或者加我微信 发你所有的

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       1. 进哥，你好：
          我也想找家猪的mature miRNA和hairpin的序列。我看网上别人是直接把整个mature.fa的下载下来，然后通过脚本只把目标物种的miRNA提取出来，想问问您这该怎么做呀？小白实在是查不到了。期待您的解答！

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          1. 加我微信 我发你吧

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             1. 进哥，您好：同求猪的miRNA成熟前体序列，Thanks♪(･ω･)ﾉ

             2. 您好 加进去了 猪的数据 Sus scrofa

14. 收到了 万分感谢您的帮助！

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15. 非常感谢您的分享！请问方便帮忙找一下牙鲆（Paralichthys olivaceus）的吗？谢谢了！

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    1. 您好 我看Paralichthys olivaceus的记录很少，20条？ 我直接发你邮箱吧

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16. 非常感谢您的无私分享！我现在在做植物的miRNA但是在mirbase上也找不到相应种属的基因，请问有什么建议吗？

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    1. 具体是哪个种属，我看看能不能查到

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       1. 枳椇子（Hovenia acerba Lindl），谢谢！

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