Posted on 2021-12-232021-12-23 从0开始，准确又快速利用Oligo7设计PCR引物 Primer Premier 5.0 安装使用 最实用的NCBI和PrimerBank在线引物设计窍门！ 基于qPrimerDB的qPCR引物检索小程序 qPCR引物序列查询数据库 MethPrimer：DNA甲基化PCR引物的设计 打赏赞(9)微海报分享 By 进哥哥 分子生物学Tags: 引物
您好，想问一下采用MethPrimer设计出来的DNA甲基化PCR的引物，我该如何检索引物特异性呢？或者说我在文献里看到的这个MSP的引物，我如何能够知道这个是引物扩增出来的片段是对应基因组的那个地方呢，望大神指点一二，谢谢！！ 回复
您好 转换之后的序列引物的特异性基本问题不大 转换之后的可以用NCBI primer blast，文献中的怎么确定位置 可以下载基因组序列之后手动将CpG位点5 一端胞嘧啶转化为尿嘧啶，即C-U，或者利用methyprimer获得转换之后的序列，然后利用软件或者直接检索引物序列 回复
您好，premiRNA的序列可以从miRBase数据库中检索得到，可能国内访问会很慢，我自建了一个小数据库：miRBase数据库序列查找 得到序列后，设计检测pre-miRNA的引物的流程就和编码基因CDS区引物设计相似，我的想法是可以跨mature miRNA序列设计qPCR引物。当然，保险起见，可以多设计几对引物扩增不同片段，以保证结果可靠 回复
老师您好，请问我想要在没有全测序的物种中扩增一个基因，师姐给我的建议是让我比对该基因在已研究的物种中的同源性，然后在同源性高的位置设计简并引物，我进行了比对以后得到了很高保守的区域，接下来如何得到简并序列和设计引物可以教一下吗？ 回复
您好，想问一下采用MethPrimer设计出来的DNA甲基化PCR的引物，我该如何检索引物特异性呢？或者说我在文献里看到的这个MSP的引物，我如何能够知道这个是引物扩增出来的片段是对应基因组的那个地方呢，望大神指点一二，谢谢！！
您好 转换之后的序列引物的特异性基本问题不大 转换之后的可以用NCBI primer blast，文献中的怎么确定位置 可以下载基因组序列之后手动将CpG位点5 一端胞嘧啶转化为尿嘧啶，即C-U，或者利用methyprimer获得转换之后的序列，然后利用软件或者直接检索引物序列
老师您好，请问如何设计引物检测pre-miRNA呀?
您好，premiRNA的序列可以从miRBase数据库中检索得到，可能国内访问会很慢，我自建了一个小数据库：miRBase数据库序列查找
得到序列后，设计检测pre-miRNA的引物的流程就和编码基因CDS区引物设计相似，我的想法是可以跨mature miRNA序列设计qPCR引物。当然，保险起见，可以多设计几对引物扩增不同片段，以保证结果可靠
老师您好，请问我想要在没有全测序的物种中扩增一个基因，师姐给我的建议是让我比对该基因在已研究的物种中的同源性，然后在同源性高的位置设计简并引物，我进行了比对以后得到了很高保守的区域，接下来如何得到简并序列和设计引物可以教一下吗？
你好，我没有做过，网上给您找了一篇教程，大概看了一下，应该可行实例图解简并引物设计（By Raindy）