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常用的图像分析软件可对组织化学和细胞化学染色结果结果进行定量分析。常用的图像分析软件有OSIRIS/GSA Image Analyser、Imagej、Image Pro Plus(IPP)等。Imagej是美国NIH开发的一款在生物医学中应用十分广泛的免费软件,下载地址为https://imagej.nih.gov/ij/ 。该软件的显著优势是开源、免费,不受电脑系统(官网提供适用不同操作系统的版本)的限制且功能强大。在组织学中,组织样本中疾病标志物的免疫组化(IHC)为疾病分级提供了诊断指标,这将影响病人的治疗策略制定。到目前为止,组织样本的病理学分析依旧是一项耗时且依赖主观判断的工作,然而对抗体作色的强弱直接进行人为的判断会带有明显的视觉误差。因此来自印度的科学工作者基于Imagej软件设计了一款插件来实现IHC电子图片的自动定量分析和评分。今天给大家分享一个基于Imaegj的免疫组化图片分析神器:IHC Profiler。

IHC Profiler插件免费下载地址:https://sourceforge.net/projects/ihcprofiler/。

安装方法:

IHC Profiler插件使用方法:

由文献可知,胞浆着色的IHC图片读入图片后可快速得到自动评分结果:

对于细胞核着色的IHC图片:

计算Score的公式为:

Score有四个等级,分别为4/3/2/1,High Positve为4分,Positive为3分,Low Positive为2分,negative 为1分。

软件实操如下:

1、 打开Imagej软件,软件界面如下:

File,Open,打开胞浆着色的图片:

2、 点击Plugins,点击IHC Profiler,进入以下界面:

询问是否是胞浆着色,下拉可选择核着色,此处选择胞浆着色,点击OK,进入以下界面,选择H DAB点击OK。

得到结果为High Positive:

而对于胞核着色,操作略微不同:

1、 打开Imagej软件,打开胞核着色图片:

2、 点击Plugins,点击IHC Profiler,进入以下界面,选择胞核着色:

同上选择H DAB,点击OK

进入以下界面:

调节Threshold阈值选中所有核着色,点击Plugins,选择IHC Profiler Macro,得到结果:

4 Replies to “ImageJ对免疫组化图片定量评价和自动评分”

  1. 您好,IHC Profile怎么分析的不稳定啊,同一张图片分析了三次,结果都不一样

  2. 老师您好,请问最后的结果提示“The score is Negative ”应该怎么分析呢?

    1. 你好,最后结论这张片子是negative或positive,这个结论可以用来分析总体阳性率。如果多数片子插件给的结论都是negative,这时候需要分析的话就采用上面更具体的强阳,阳性,弱阳,阴性的具体比例进行统计分析。总的结论只是软件根据自己的参数设定给出的,你计算只需要上述具体比例就好

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