该app基于R语言ClusterProfiler包写的富集分析小程序，目前版本仅支持传统的ORA（Over-Representation Analysis）分析，而非GSEA富集分析，这与大家熟知的DAVID类似，考量的是差异表达基因（或给定的基因集）的功能。后续有空的时候会整合进去GSEA的模块，相比较ORA而言，其更具有价值。

clusterProfiler：富集分析和可视化的强大工具

其实这个包的分析过程不复杂，这个app主要面向R语言萌新，当然想学习或者开发的同学，都可以看看。做这些，主要是为了方便，集成，有建议请提出.

数据上传

对于差异分析结果的分析：上传文件为差异分析结果文件，仅支持CSV格式文件。

对于自定义基因集的分析：点击upload genelist，贴入基因列表

参数设置

KeyType一定要选择正确，大家可能习惯基因名字，就选择gene symbol

富集分析

点击create EnrichGO Object按钮，即可进行富集分析。

根据输入基因多少，所需时间也不一样，耐心等待。

如果没有富集结果，右下角会有窗口提示。

EnrichGO和enrichKEGG模块可以下载富集分析结果

可视化

参数设置比较简单，不多介绍，如有其它可视化建议，可以留言

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GSEA模块开发中

任何建议，欢迎留言

APP代码获取（ID3）

B站代码获取