R语言获取所有基因3’UTR序列 By 进哥哥Posted on 2022-12-012022-12-01 R语言 3’UTR序列获取目的:用于批量miR […] R语言获取所有基因3’UTR序列 Read More
Nomogram(诺莫图/列线图)及其Calibration校准曲线绘制 By 进哥哥Posted on 2022-11-242022-11-24 R语言 生信资料 Nomogram,中文常称为诺莫图或者列线图。简单 […] Nomogram(诺莫图/列线图)及其Calibration校准曲线绘制 Read More
新版TCGA突变maf数据下载整合及瀑布图绘制和TMB计算 By 进哥哥Posted on 2022-11-022022-11-02 R语言 我们经常会在SCI文章里面看到下面这样的图来,展示 […] 新版TCGA突变maf数据下载整合及瀑布图绘制和TMB计算 Read More
为何predict()函数计算的Riskscore不等于基因的表达量与其系数的乘积的加权呢? By 进哥哥Posted on 2022-09-262022-09-26 R语言 生信资料 有同学发邮件问我这个问题,我以前还真没有留意过,也 […] 为何predict()函数计算的Riskscore不等于基因的表达量与其系数的乘积的加权呢? Read More
个性化调整GSEAplot By 进哥哥Posted on 2022-09-232022-09-23 R语言 我们经常使用Y叔的clusterprofiler包 […] 个性化调整GSEAplot Read More
R语言报错:Error in while (change > conv) { : missing value where TRUE/FALSE needed By 进哥哥Posted on 2022-09-222022-09-22 Uncategorized 最近在用OncoPredict包进行药物敏感性预测 […] R语言报错:Error in while (change > conv) { : missing value where TRUE/FALSE needed Read More
药物敏感性预测R包之oncoPredict By 进哥哥Posted on 2022-09-212022-10-09 新药研发 生信资料 药物预测需要训练集,一般来说推荐使用权威资源作为训 […] 药物敏感性预测R包之oncoPredict Read More
绘制Time-dependent ROC 曲线 By 进哥哥Posted on 2022-09-182022-09-18 R语言 生信资料 概念 通常我们对于biomarker的预测模型会用 […] 绘制Time-dependent ROC 曲线 Read More
t检验和Wilcoxon秩和检验 By 进哥哥Posted on 2022-08-032022-08-03 R语言 生信资料 统计软件 t检验和wilcoxon秩和检验是用于检验两独立样 […] t检验和Wilcoxon秩和检验 Read More
R语言批量计算一个基因的表达相关基因 By 进哥哥Posted on 2022-07-282022-07-28 R语言 代码不一定是最优化的,根据实际情况修改使用 将上述 […] R语言批量计算一个基因的表达相关基因 Read More