为何predict()函数计算的Riskscore不等于基因的表达量与其系数的乘积的加权呢? By 进哥哥Posted on 2022-09-262022-09-26 R语言 生信资料 有同学发邮件问我这个问题，我以前还真没有留意过，也 […] 为何predict()函数计算的Riskscore不等于基因的表达量与其系数的乘积的加权呢? Read More
个性化调整GSEAplot By 进哥哥Posted on 2022-09-232022-09-23 R语言 我们经常使用Y叔的clusterprofiler包 […] 个性化调整GSEAplot Read More
R语言报错：Error in while (change > conv) { : missing value where TRUE/FALSE needed By 进哥哥Posted on 2022-09-222022-09-22 Uncategorized 最近在用OncoPredict包进行药物敏感性预测 […] R语言报错：Error in while (change > conv) { : missing value where TRUE/FALSE needed Read More
药物敏感性预测R包之oncoPredict By 进哥哥Posted on 2022-09-212022-09-21 新药研发 生信资料 药物预测需要训练集，一般来说推荐使用权威资源作为训 […] 药物敏感性预测R包之oncoPredict Read More
绘制Time-dependent ROC 曲线 By 进哥哥Posted on 2022-09-182022-09-18 R语言 生信资料 概念 通常我们对于biomarker的预测模型会用 […] 绘制Time-dependent ROC 曲线 Read More
t检验和Wilcoxon秩和检验 By 进哥哥Posted on 2022-08-032022-08-03 R语言 生信资料 统计软件 t检验和wilcoxon秩和检验是用于检验两独立样 […] t检验和Wilcoxon秩和检验 Read More
R语言批量计算一个基因的表达相关基因 By 进哥哥Posted on 2022-07-282022-07-28 R语言 代码不一定是最优化的，根据实际情况修改使用 将上述 […] R语言批量计算一个基因的表达相关基因 Read More
TIDE数据标准化：R语言每行减去平均值 By 进哥哥Posted on 2022-07-192022-07-19 R语言 生信资料 最近很多人借TIDE账号，也有人问我如何进行数据标 […] TIDE数据标准化：R语言每行减去平均值 Read More
GSE83521/GSE89143去除批次效应 By 进哥哥Posted on 2022-06-072022-06-07 R语言 老大在群里出的题，说感觉这个热图很诡异，然后中间我 […] GSE83521/GSE89143去除批次效应 Read More
ggtranscript 绘制转录本结构 By 进哥哥Posted on 2022-06-042022-06-04 R语言 1引言 今天分享一个绘制转录本的 R 包 ggtr […] ggtranscript 绘制转录本结构 Read More