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标签: TCGA

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24年新版TCGA GDC data portal 2.0界面介绍及数据下载教程

By 进哥哥Posted on 2024-02-252024-02-25
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TCGA(The Cancer Genome At […]

24年新版TCGA GDC data portal 2.0界面介绍及数据下载教程 Read More

小程序分享:TCGA mRNA/miRNA数据下载、合并、差异分析及可视化

By 进哥哥Posted on 2023-09-122023-09-12
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1. 数据下载 新版TCGA表达mRNA/miRN […]

小程序分享:TCGA mRNA/miRNA数据下载、合并、差异分析及可视化 Read More

工具分享:一键TCGA转录组数据合并+基因差异表达分析+火山图绘制

By 进哥哥Posted on 2023-08-092023-09-02
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自从去年发了个TCGA数据下载合并的教程之后,不少 […]

工具分享:一键TCGA转录组数据合并+基因差异表达分析+火山图绘制 Read More

TCGA数据库单个基因甲基化位点分析

By 进哥哥Posted on 2023-07-122023-07-24
  • R语言
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TCGA数据库是一个包括33种癌的各个组学的数据库 […]

TCGA数据库单个基因甲基化位点分析 Read More

3大数据库超2万RNA-seq数据重新统一处理——关于TCGA-GTEx是否需要标准化

By 进哥哥Posted on 2023-05-242023-05-25
  • 生信资料

这里使用的数据都是已经标准化去批效应的了,具体如下 […]

3大数据库超2万RNA-seq数据重新统一处理——关于TCGA-GTEx是否需要标准化 Read More

新版TCGA突变maf数据下载整合及瀑布图绘制和TMB计算

By 进哥哥Posted on 2022-11-022024-02-25
  • R语言

我们经常会在SCI文章里面看到下面这样的图来,展示 […]

新版TCGA突变maf数据下载整合及瀑布图绘制和TMB计算 Read More

TCGA的样本命名(Barcode)详解

By 进哥哥Posted on 2022-10-122022-10-16
  • 生信资料

Sample:其中编号01~09表示肿瘤,10~1 […]

TCGA的样本命名(Barcode)详解 Read More

新版TCGA表达mRNA/miRNA和临床数据下载及R语言整合代码

By 进哥哥Posted on 2022-07-162023-09-23
  • R语言
  • 生信资料

以肺腺癌数据(TCGA-LUAD)为例,为了用TC […]

新版TCGA表达mRNA/miRNA和临床数据下载及R语言整合代码 Read More

GTEx联合TCGA数据库差异分析(更新)

By 进哥哥Posted on 2022-03-162024-05-09
  • R语言

GTEx(Genotype-Tissue Expr […]

GTEx联合TCGA数据库差异分析(更新) Read More

TCGA中配对样本的可视化

By 进哥哥Posted on 2021-12-282021-12-28
  • R语言

0.需求 TCGA里的数据tumor多normal […]

TCGA中配对样本的可视化 Read More
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关于我

王 进(Jingle)

本网站主要用于个人科研方法整理以及生活分享,欢迎各位留言一起学习探讨,共同进步。如果想更多的了解我,欢迎查看我的简历。

很多留言不能及时给大家回复讨论,深感歉意!现在太忙了,如果有急需要讨论合作的可以直接加微信,也可以进科研互助群讨论。

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